Dysbiose et antibiotiques : Les probiotiques à base de levure peuvent-ils aider ?

Sarah Glinski, RD 

Écrit par : Sarah Glinski, RD 

Mis à jour : January 15th, 2025

Votre intestin abrite des billions de micro-organismes et votre santé dépend de l’équilibre délicat entre les virus, les champignons et les bactéries qui s’y trouvent. Cet écosystème, appelé collectivement microbiote intestinal, joue un rôle essentiel dans la digestion, la fonction immunitaire et le bien-être général. Cependant, les antibiotiques peuvent perturber cet équilibre délicat. Bien qu’ils soient efficaces pour éliminer les bactéries nocives, ils peuvent également perturber l’équilibre entre les microbes bénéfiques et nocifs de l’intestin, ce qui entraîne une condition connue sous le nom de dysbiose intestinale.

La dysbiose intestinale peut entraîner divers problèmes de santé, notamment des troubles digestifs. Lisez ce qui suit pour savoir comment la dysbiose et les antibiotiques sont liés et comment les probiotiques à base de levure peuvent restaurer le microbiote et contrecarrer les effets négatifs des antibiotiques.

Qu’est-ce que la dysbiose ?

En règle générale, un intestin sain contient une population diversifiée et équilibrée de micro-organismes qui contribuent à la digestion, à l’absorption des nutriments, à la fonction immunitaire et à la protection contre les micro-organismes nocifs. La dysbiose survient lorsque cet équilibre est rompu, souvent en raison de facteurs tels que l’utilisation d’antibiotiques, des changements alimentaires, le stress, la maladie ou des facteurs environnementaux.

Par conséquent, lorsque l’équilibre est rompu, il peut entraîner une diminution des microbes bénéfiques et une prolifération des microbes nocifs, ce qui peut entraîner divers problèmes de santé.

Symptômes de dysbiose

Selon la Cleveland Clinic, plusieurs symptômes sont associés à la dysbiose intestinale, notamment

dysbiose symptôme de ballonnement

Quelles sont les causes de la dysbiose ?

La dysbiose peut être causée par différents facteurs, dont l’alimentation et le stress.

Régime riche en sucres simples

Des études menées sur des rats montrent que la diversité bactérienne diminue et que les bactéries potentiellement nocives augmentent lorsque le régime alimentaire est riche en sucre. En outre, les substances chimiques inflammatoires et le lipopolysaccharide (un composé inflammatoire produit par certaines bactéries) augmentent. Cela démontre que le microbiote intestinal est capable de provoquer une inflammation s’il est déséquilibré.

Régime hyperprotéiné

Les régimes riches en protéines peuvent être pauvres en glucides et donc en fibres. Certaines bactéries peuvent métaboliser les fibres en acides gras à chaîne courte (AGCC), des composés qui alimentent les cellules du côlon et peuvent réduire l’inflammation. Les régimes riches en protéines sont associés à une diminution des microbes bénéfiques producteurs d’AGCC (probablement en raison d’un apport moindre en fibres) et à une augmentation des bactéries qui décomposent les protéines. La dégradation des protéines par les bactéries produit des composés qui peuvent être nocifs pour la santé des cellules du côlon.

Régime riche en graisses

Une alimentation riche en graisses (45%-65% des calories provenant des graisses) est associée à une dysbiose. Plus précisément, elle est associée à une diminution des Bacteroidetes bénéfiques et à une augmentation des Firmicutes et des Proteobacteria dans des expériences menées sur des souris. Elle est également associée à une augmentation des bactéries qui créent des substances affaiblissant la barrière intestinale, ce qui entraîne une perméabilité intestinale accrue (c’est-à-dire un “intestin qui fuit”).

Le stress

Des études menées auprès du personnel de santé de première ligne pendant la pandémie de COVID-19 ont montré que le stress perturbe considérablement la composition du microbiote intestinal. Cette dysbiose intestinale persiste pendant au moins six mois après la disparition de la source de stress.

Mauvais usage de l’alcool

L’abus d’alcool est associé à une dysbiose et à une prolifération bactérienne intestinale, tant dans les études animales que chez les personnes souffrant d’abus d’alcool. Cette dysbiose peut conduire au développement d’une maladie du foie.

Autres causes de dysbiose

Les autres causes de dysbiose sont la malnutrition, les infections intestinales, la vieillesse, la nutrition par voie liquide ou intraveineuse, le diabète ou le syndrome métabolique, et le tabagisme.

Les antibiotiques peuvent-ils provoquer une dysbiose ?

Outre les autres causes évoquées, les antibiotiques peuvent également provoquer une dysbiose. En particulier, les antibiotiques peuvent entraîner une perte de diversité microbienne, des changements dans l’abondance de certains groupes de microbes et la croissance de bactéries résistantes aux antibiotiques.

Le traitement par des antibiotiques courants est associé à une diminution des microbes bénéfiques tels que les espèces Bifidobacterium et Lactobacillus . Ces changements peuvent affaiblir la barrière intestinale, qui fait partie intégrante du système immunitaire.

Comment diagnostiquer une dysbiose

Plusieurs tests sont disponibles pour diagnostiquer la dysbiose, mais ils ne sont pas tous exacts.

La prolifération des bactéries de l’intestin grêle (SIBO), un type d’infection de l’intestin grêle, peut être diagnostiquée en prélevant un échantillon de liquide de l ‘intestin grêle et en déterminant les microbes qui peuvent être cultivés en laboratoire à partir de cet échantillon. Il est également possible de diagnostiquer le SIBO en effectuant un test consistant à respirer dans un tube et à mesurer la quantité d’hydrogène ou de méthane produite.

Les analyses de selles peuvent également être utilisées pour déterminer l’équilibre global des bactéries et des levures dans l’intestin. Un processus appelé réaction en chaîne de la polymérase (PCR, une technique qui produit de nombreuses copies d’un segment d’ADN spécifique, comme une photocopieuse pour le matériel génétique) peut déterminer le rapport entre les bactéries bénéfiques et les bactéries nocives. Toutefois, cette méthode est limitée par le fait que nous ne savons toujours pas ce qui constitue un microbiote intestinal “sain”. Alors que nous apprenons à quoi ressemble la dysbiose, il est plus difficile de définir un microbiote intestinal sain.

En plus de tester les types de microbes présents, certains composés peuvent nous donner des indices sur la santé de notre microbiote intestinal. Il s’agit notamment de composés tels que l’oxyde de triméthylamine-N (TMAO), les AGCS et la zonuline (une protéine présente dans la barrière intestinale). Par exemple, le TMAO pourrait indiquer la présence de bactéries nuisibles, tandis que les AGCS indiquent la présence de bactéries bénéfiques.

La dysbiose peut-elle provoquer d’autres maladies chroniques ?

En outre, la dysbiose est associée à plusieurs pathologies, notamment la prolifération des bactéries de l’intestin grêle (SIBO), les maladies inflammatoires de l’intestin (MICI) et l’athérosclérose (accumulation de plaques dans les artères).

Croissance bactérienne de l’intestin grêle

On parle de SIBO lorsque les bactéries qui habitent généralement le côlon sont présentes en grande quantité dans l’intestin grêle. Il est associé à des symptômes tels que des douleurs abdominales, des gaz, des ballonnements, des diarrhées et des selles irrégulières. S’il n’est pas traité, le SIBO peut entraîner une malabsorption des nutriments et des carences nutritionnelles.

Maladies inflammatoires de l’intestin (MICI)

La dysbiose est couramment observée chez les personnes atteintes de maladies inflammatoires de l’intestin (MII), mais nous n’avons pas encore déterminé si la dysbiose est une cause ou une conséquence de la maladie.

Syndrome de l’intestin irritable (SII)

Jusqu’à 10 % des personnes souffrant du syndrome de l’ intestin irritable ont eu une infection intestinale qui a entraîné une dysbiose intestinale à l’origine du syndrome de l’intestin irritable. C’est ce que l’on appelle le SII post-infectieux. Cela démontre que la dysbiose peut avoir des effets durables sur notre santé.

L’athérosclérose

L’athérosclérose est la principale cause de maladie cardiaque dans le monde. Il a été démontré que la dysbiose intestinale contribue au développement de la maladie cardiovasculaire athéroscléreuse (MCV) par plusieurs voies.

Le microbiote intestinal produit des sous-produits métaboliques tels que la triméthylamine (TMA), qui se transforme en triméthylamine-N-oxyde (TMAO). Ce composé favorise le durcissement des artères.

En outre, les AGCS réduisent l’inflammation et l’athérosclérose. S’il n’y a pas suffisamment de microbes producteurs d’acides gras saturés, une inflammation chronique de faible intensité peut persister et conduire au développement de conditions associées à l’athérosclérose, telles que le syndrome métabolique et le diabète de type 2.

Comment traiter la dysbiose

Il existe de nombreux traitements émergents pour la dysbiose. Il est préférable de discuter de ces traitements potentiels avec un professionnel de la santé afin de s’assurer que vous choisissez un traitement adapté à votre situation spécifique.

Prébiotiques

Les prébiotiques sont des substances utilisées de manière sélective par les microbes intestinaux bénéfiques pour la santé. Considérez-les comme des engrais qui créent un environnement optimal pour le développement des bons microbes intestinaux. Récemment, on s’est intéressé à l’utilisation des prébiotiques pour traiter les affections causées par la dysbiose.

Les prébiotiques peuvent être obtenus par le biais de l’alimentation. La racine de chicorée, les céréales complètes, l’oignon, l’ail, l’asperge, la banane et le topinambour sont de bonnes sources de prébiotiques. Veillez à les intégrer lentement à votre alimentation, car une augmentation trop rapide de votre consommation peut entraîner des gaz et des ballonnements.

Levures Probiotiques

Alors que la plupart des probiotiques utilisés pour traiter la dysbiose sont des bactéries bénéfiques, un nombre croissant de preuves suggère que les probiotiques à base de levure tels que Saccharomyces boulardii CNCM I-745 peuvent prévenir efficacement la dysbiose et la diarrhée associées aux antibiotiques.

Les probiotiques à base de levure sont particulièrement bénéfiques pour prévenir la diarrhée associée aux antibiotiques car, contrairement aux probiotiques à base de bactéries, les probiotiques à base de levure ne sont pas détruits par les antibiotiques. Vous pouvez donc les prendre en même temps que les probiotiques. Des études montrent que lorsqu’il est pris en même temps que des antibiotiques, S. boulardii réduit efficacement le risque de diarrhée associée aux antibiotiques chez les adultes et les enfants.

S. boulardii recouvre la muqueuse intestinale de milliards de micro-organismes, empêchant ainsi la prolifération de bactéries nocives dans l’intestin. En d’autres termes, les cellules de levure agissent comme un bouclier temporaire dans l’intestin, ce qui permet de rétablir plus rapidement un microbiote sain.

Acides gras oméga-3

De plus en plus de preuves suggèrent que les acides gras oméga-3 (tels que ceux que l’on trouve dans les graines de lin ou les poissons gras) peuvent modifier le microbiote intestinal et augmenter la quantité de microbes bénéfiques dans l’intestin. Certains chercheurs suggèrent même que les acides gras oméga-3 soient considérés comme des prébiotiques (au même titre que certains types de fibres).

Transplantation de microbiote fécal (TMF)

Dans les cas de dysbiose intestinale grave (comme l’infection à Clostridioides difficile ou les MICI), la transplantation de microbiote fécal a été utilisée avec succès pour traiter la dysbiose. La FMT consiste à transférer les selles d’un donneur sain dans l’intestin d’une personne souffrant de dysbiose intestinale. Cela revient à transplanter des bactéries saines de l’intestin d’une personne dans celui d’une autre pour l’aider à rétablir l’équilibre de son microbiote. Cependant, les recherches concernant la sécurité et l’efficacité de la FMT se poursuivent. D’autres essais cliniques chez l’homme sont nécessaires avant que ce traitement puisse être recommandé pour traiter la dysbiose.

FAQ

Les antibiotiques peuvent-ils provoquer des diarrhées ?

Oui, les antibiotiques peuvent provoquer des diarrhées en raison de leur effet négatif sur le microbiote intestinal.

Les antibiotiques provoquent-ils la constipation ?

Les antibiotiques ne provoquent généralement pas de constipation. En fait, il est de plus en plus évident que les antibiotiques peuvent être utilisés pour traiter la constipation chronique et le syndrome de l’intestin irritable à prédominance de constipation.

Peut-on prendre des probiotiques avec des antibiotiques ?

Une revue Cochrane suggère que la prise de probiotiques avec des antibiotiques prévient la diarrhée associée aux antibiotiques. Les probiotiques les plus souvent proposés à cette fin sont Lactobacillus rhamnosus et S. boulardii.

Peut-on prendre trop de probiotiques ?

La plupart des probiotiques contiennent des doses élevées de bactéries et de levures bénéfiques, qui sont généralement bien tolérées. Bien que l’on ne sache pas vraiment s’il existe une limite supérieure à la quantité de probiotiques que vous pouvez prendre, il est préférable de suivre les conseils de votre fournisseur de soins de santé ou les instructions fournies avec votre probiotique.

Qu’est-ce qu’un régime SIBO ?

Certains recommandent un régime pauvre en FODMAP pour le SIBO. Les FODMAPs sont des glucides qui sont fermentés par les microbes de l’intestin. On pense que l’élimination temporaire de ces aliments peut “affamer” les microbes de l’intestin grêle. Toutefois, ce régime peut également entraîner des changements défavorables pour les microbes bénéfiques de votre intestin et ne devrait être suivi que sous la supervision d’un professionnel de la santé.

Principaux enseignements

Conclusion

Le maintien d’un microbiote intestinal sain est essentiel pour le bien-être général, en particulier lorsque des facteurs tels que l’utilisation d’antibiotiques peuvent perturber l’équilibre. En reconnaissant les symptômes de la dysbiose et en comprenant ses causes, vous pouvez prendre des mesures proactives pour rétablir votre santé intestinale. Les probiotiques à base de levure, comme S. boulardii , constituent un moyen prometteur de contrecarrer les effets négatifs des antibiotiques et de favoriser la santé de l’intestin.

Si vous avez des problèmes digestifs ou si vous prenez des antibiotiques, envisagez d’intégrer des probiotiques à base de levure à votre routine et consultez un professionnel de la santé pour obtenir des conseils personnalisés.

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