Démystifier la dysbiose

Écrit par : Kristina Campbell

Mis à jour : November 7th, 2022

La dysbiose est un concept utile mais n’a de pertinence médicale que lorsqu’elle est liée à un résultat de santé.

Living in the dark depths of your intestines is a diverse community of microorganisms of all shapes and sizes—the bacteria as well as fungi and archaea (ancient microorganisms) that make up your gut microbiome. At any given moment, some of the bugs swim around frantically while others hide out. Some bugs fight their neighbors while others devour food sources and replicate, in a continual circle of life.

Un jour, disons que des visiteurs indésirables arrivent dans l’intestin : une population de microbes désagréables et pathogènes appelés pathogènes. Ces microbes libèrent des produits chimiques toxiques et commencent à engloutir toutes les sources d’énergie, affamant la population locale de microbes. Les choses deviennent encore plus chaotiques lorsque le système immunitaire passe à la vitesse supérieure pour tenter de contrôler les agents pathogènes.

Parfois, après un événement comme celui-ci, la communauté originale de microbes rebondit tout de suite. Mais d’autres fois, de nombreux membres manquent à l’appel alors que la communauté se rassemble. Le microbiome intestinal peut devenir moins diversifié dans l’ensemble, tandis que certains des insectes qui ne prospéraient pas auparavant, comme les bactéries qui aiment l’oxygène, trouvent soudainement les conditions idéales pour leur croissance.

Such a situation is often called ‘dysbiosis’—the gut microbiome shifting away from its normal state. This shift can be brought about not just by pathogen infections, but also by low-fibre diets, over-use of antibiotics, and several other factors.

Le concept de base de la dysbiose est assez facile à saisir : un microbiome perturbé ou appauvri. Mais comment les scientifiques le mesurent-ils ? Et que signifie la dysbiose pour la santé ?

En creusant dans la science, voici les quatre principales choses que vous devez savoir sur le concept de dysbiose dans le microbiome intestinal.

La dysbiose doit être liée à un résultat de santé.

Il est possible de souffrir d’une infection gastro-intestinale et de récupérer parfaitement, sans conséquences durables sur la santé. Ainsi, toute perturbation du microbiome intestinal qui se produit dans ce scénario serait médicalement dénuée de sens.

La dysbiose n’est pas une “fin” en soi – elle ne devient importante que lorsqu’elle peut signaler des problèmes de santé actuels ou futurs. Ainsi, de nombreux scientifiques du microbiome travaillent actuellement à identifier les types de perturbations du microbiome intestinal qui ont des conséquences réelles sur la santé, telles que des symptômes gastro-intestinaux ou même des maladies digestives chroniques. Et sachant que le microbiome intestinal est intimement lié à certains aspects de la santé humaine, ils s’efforcent de déterminer si le microbiome intestinal est la cause directe de tout problème de santé qui survient après une perturbation du microbiome.

La mesure de la dysbiose dépend de la capacité à définir ce qui est normal.

Pour chaque paramètre corporel, de la pression artérielle aux métabolites urinaires, les scientifiques doivent connaître la plage de ce qui est normal avant de savoir si quelque chose est anormal.

L’un des premiers projets de microbiome à grande échelle au monde, le Human Microbiome Project, a pour objectif de définir un microbiome normal ou sain. Mais les scientifiques se sont heurtés à un problème : les personnes en bonne santé ont un si large éventail de communautés microbiennes intestinales que les « drapeaux rouges » signalant des problèmes de santé actuels ou futurs étaient extrêmement difficiles à trouver.

Depuis lors, les mathématiques avancées et les méthodes d’apprentissage automatique ont aidé les scientifiques à se rapprocher de la mesure de la dysbiose de manière significative. Une entreprise a proposé un «indice de santé du microbiome» qui calcule la relation entre quatre groupes bactériens jugés importants pour prédisposer les individus à la maladie. Et en 2020, un groupe de scientifiques a proposé un indice qui classait les personnes comme “saines” ou “non saines” sur la base de 50 espèces de microbes dans leurs intestins. Cependant, aucun de ceux-ci n’a été suffisamment testé pour devenir un marqueur accepté de la dysbiose.

En fait, la science la plus récente ajoute une autre couche de complexité. Une étude de 2022 a mis en doute la compréhension commune selon laquelle le microbiome intestinal à l’âge adulte est stable. Il a été démontré que le microbiome intestinal variait considérablement au fil du temps chez le même individu, de sorte que toute mesure fiable de la dysbiose devra tenir compte de ces variations normales.

Il existe probablement de nombreuses variétés de dysbiose.

Certains scientifiques ont proposé que la clé de la dysbiose pourrait provenir de la première ligne du célèbre roman de Tolstoï, Anna Karénine :

“Les familles heureuses se ressemblent toutes; chaque famille malheureuse est malheureuse à sa manière.”

De même, chaque microbiome intestinal « heureux » remplit les fonctions nécessaires à la santé, mais chaque dysbiose est différente et a une implication différente sur la santé. Ainsi, après une infection gastro-intestinale majeure, par exemple, une personne peut se retrouver avec un microbiome intestinal perturbé qui la prédispose au syndrome du côlon irritable, tandis que le microbiome intestinal perturbé d’une autre personne (en combinaison avec une mauvaise alimentation, peut-être) peut préparer le terrain pour colorectal cancer.

Cela signifie que les scientifiques doivent étudier les maladies une par une, d’une manière qui leur permette de lier systématiquement une maladie à une certaine dysbiose mesurable.

L’avenir réserve des solutions spécifiques pour la dysbiose.

À l’avenir, nous disposerons probablement de moyens spécifiques et personnalisés pour éviter les états de dysbiose : par exemple, des antibiotiques adaptés, des probiotiques ou des mélanges de différentes fibres ; peut-être même des « insectes en tant que médicaments » qui sont testés et dont il a été démontré qu’ils préviennent une maladie en agissant par l’intermédiaire du microbiome intestinal.

Mais jusqu’à ce que cet avenir arrive, nous pouvons utiliser des stratégies plus générales pour réduire les risques d’avoir un microbiome intestinal perturbé. Pratiquer une bonne hygiène et la salubrité des aliments pour réduire le risque d’infection gastro-intestinale est une stratégie gagnante. L’utilisation judicieuse des antibiotiques va également loin. Maintenir votre apport quotidien recommandé en fibres (sous réserve des conseils de votre diététiste si vous souffrez d’une maladie digestive) est un must ; vous pourriez même envisager une dose quotidienne de prébiotiques. Le monde microbien chaotique de vos intestins est encore plein de mystères. La dysbiose est un concept utile pour décrire une perturbation du microbiome intestinal, mais les scientifiques travaillent toujours pour pouvoir la mesurer et la lier à des maladies spécifiques. Avec plus de connaissances sur les types spécifiques de dysbiose, nous serons en mesure de trouver des solutions pour maintenir la santé avec l’aide de notre microbiome intestinal.

À propos de l’auteur : Kristina Campbell, rédactrice scientifique et biotechnologique, est l’auteur de The Well-Fed Microbiome Cookbook et co-auteur du manuel universitaire Gut Microbiota : Interactive Effects on Nutrition and Health (dont une deuxième édition est à paraître). Kristina se spécialise dans la traduction de la science du microbiome et aide le grand public à trier les faits de la fiction en matière de santé intestinale, de probiotiques et de prébiotiques. Elle écrit sur la science du microbiome pour les médias en ligne et imprimés à travers l’Europe et l’Amérique du Nord, et aime participer à des projets de communication scientifique. pour des publics variés. Elle détient des diplômes de l’Université de Toronto et de l’Université de la Colombie-Britannique. Voir le travail de Kristina ici.